Eine These geht davon aus, dass der Name Caesar mit dem verloren gegangenen karthagischen Wort für Elefanten zusammen hängt. Einer von Caesars Vorfahren hat sich folglich während den punischen Kriegen diesen Beinamen verdient. Für die These spricht, dass Caesars Wappentier der Elefant ist, der auch auf den Rückseiten der mit seinem Gesicht geprägten Münzen abgebildet ist.

Eine weitere These lehnt sich an den römischen Schriftsteller Plinius an. Demzufolge resultiert der Name "Caesar" aus dem Partizip Perfekt des lateinischen Wortes caedere (ausschneiden), caesus (geschnitten). Im Zusammenhang mit dem römischen Gesetz lex regia oder lex caesarea, nach dem schwangeren Frauen, die während der Geburt verstarben, das Kind aus dem Leib geschnitten werden sollte, wird der Name als "der aus dem Mutterleib Geschnittene" interpretiert. Mit einem heutigen Kaiserschnitt hängt dies nicht zusammen, da  dieser Eingriff weniger das Ziel hatte, das Kind zu retten, als vielmehr es getrennt von der Mutter begraben zu können. Es wird vermutet, dass ein früherer Vorfahre Gaius Iulius Caesars mit einem solchen Eingriff in Verbindung stand.

Das Suffix -ar ist im lateinischen Namenskontext ansonsten völlig unbekannt. Möglicherweise ist das gesamte Cognomen „Caesar“ überhaupt nicht lateinischen Ursprunges.